Cet article examine un moment crucial de l’histoire de l’Église dans ses rapports à l’institution militaire, quand la papauté formalise véritablement, en s’appuyant sur les jésuites, un modèle du « soldat chrétien », qui va désormais orienter toute la conception de la guerre et de la discipline aux armées déployée par la Contre-Réforme en Europe. Ce modèle va se diffuser progressivement sur les différents champs de bataille de la chrétienté dans la seconde moitié du xvie et au xviie siècle. Mais il est mis en pratique pour la première fois en France durant la troisième guerre civile, précisément lors de la campagne militaire de 1569, à l’occasion de l’envoi par Pie V à Charles IX d’un contingent pontifical pour appuyer le roi dans sa guerre contre les réformés. L’engagement en France de ces soldats italiens est associé à la formation d’une aumônerie jésuite, pour les encadrer religieusement, et à la rédaction par Antonio Possevino d’un manuel du soldat chrétien, premier manuel officiel composé sous l’égide de la Compagnie de Jésus, pour enseigner aux soldats et, surtout, aux nobles qui les commandent à bien mener une guerre sainte. Dans l’optique de la lutte multiforme contre les ennemis de l’Église sous Pie V (1566-1572), ce dispositif engage un processus de disciplinarisation des troupes, mais s’attache d’abord à transformer l’archétype du chevalier en quête de gloire en une éthique du service de Dieu dans un but d’efficacité militaire. Cet article explore la mise en place, en France en 1569, de ce dispositif d’encadrement religieux : il observe la manière dont ce modèle se confronte aux valeurs et pratiques nobiliaires ; il s’interroge sur ses relations avec la violence de guerre déployée lors de la bataille de Moncontour, tout en constatant l’incapacité des aumôniers jésuites à soumettre les combattants à cette discipline dévote.