L’étiologie et le développement des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), dont la maladie de Crohn (MC) et rectocolite hémorragique (RCH), sont encore mal compris. Il s’agit de maladies multifactorielles caractérisées par une dérégulation de la réponse immunitaire des muqueuses chez des individus génétiquement prédisposés, sous l’influence de facteurs environnementaux. À ce jour, seuls le tabagisme et l’appendicectomie sont décrits comme capables d’influencer le développement des MICI. Le rôle du tabac est ambivalent : il protège de la RCH mais aggrave le risque d’apparition de la MC. Néanmoins, malgré une littérature relativement abondante, il est à l’heure actuelle impossible d’assigner définitivement des propriétés immunomodulatrices particulières au tabac. De plus, aucun des modes d’actions du tabac proposés n’explique l’ambivalence observée entre la MC et la RCH. L’hypothèse la plus probable est celle d’un effet du tabac différent sur le côlon et l’intestin grêle.Partant de ces observations cliniques, ce travail a pour but de caractériser un (ou plusieurs) des mécanismes impliqués dans le rôle immunomodulateur du tabac d’une part au niveau du côlon et d’autre part au niveau de l’iléon, afin de réaliser une analyse différentielle sur ces deux organes.Deux modèles d’étude ont été mis en place sur des souris C57Bl/6. Les souris sont pré-exposées pendant 2 semaines à la fumée de cigarette via un protocole standardisé qui permet de mimer au mieux le tabagisme humain. Lors de la troisième semaine, l’inflammation est provoquée soit au niveau du côlon (traitement au DSS (Dextran Sodium Sulfate)), soit au niveau du grêle (traitement à l’indométacine). Chez les souris sauvages, l’exposition à la fumée de cigarette réduit significativement l’expression clinique de la colite et diminue l’expression des cytokines pro-inflammatoires Th1/Th17 dans le côlon. Cette protection est spécifique au côlon : aucune différence n’a pu être observée sur les paramètres cliniques de l’inflammation dans le modèle d’iléite.L’analyse des populations cellulaires met en évidence une augmentation de la proportion de lymphocytes iNKT au niveau du foie et du côlon (mais pas au niveau du grêle) des souris exposées. Ces cellules sont indispensables à l’effet protecteur lié à la fumée de cigarette au niveau du colon. En effet, la protection contre la colite au DSS liée à la fumée est abolie chez des souris déficientes en cellules NKT fonctionnelles. Par contre, dans le modèle d’iléite à l’indométacine, les souris déficientes en NKT montrent une sensible diminution de l’inflammation iléale lorsqu’elles sont exposées à la fumée de cigarette.Ces résultats semblent indiquer que les cellules iNKT joueraient un rôle différent en fonction de leur localisation dans le tractus intestinale, ou que des sous-populations différentes de cellules iNKT seraient impliquées dans le contrôle immunitaire dans le côlon et l’intestin grêle.Ce travail démontre clairement que, expérimentalement, la fumée de cigarette protège les souris de la colite mais pas de l’iléite. Pour la première fois, les cellules iNKT ont été identifiées comme ayant un rôle majeur dans la protection du côlon liée à la fumée de cigarette, tout en jouant potentiellement un rôle différent au niveau de l’iléon.Cette thèse apporte des données nouvelles et originales dans le domaine de la régulation de l’inflammation intestinale notamment par la fumée de cigarette, un facteur environnemental largement répandu. En outre, cibler les cellules iNKT pourrait constituer un nouveau moyen de contrôle de l’inflammation intestinale. La conception de nouvelles molécules agissant sur la polarisation des cellules iNKT pourrait faire l’objet d’une nouvelle voie thérapeutique visant à diminuer l’inflammation colique, en particulier au cours de la RCH.