Le projet renanien d’une embryogénie de l’esprit humain trouve sa réalisation la plus aboutie dans les deux sommes historiques que sont l’Histoire des origines du christianisme et l’Histoire du peuple d’Israël. Il s’agit pour Renan de remonter aux origines des religions et des langues, en les pensant non seulement selon un modèle organiciste, mais elles-mêmes comme des objets naturels, les produits de l’esprit humain obéissant pour lui aux mêmes lois de nature. Ce projet historien trouve un débouché stylistique dans une imagerie naturaliste qui structure l’ensemble de ses textes. Le projet d’une embryogénie de l’esprit humain trouve alors sa dernière actualisation dans la réalisation d’un texte lui-même pensé comme organisme.