Les missions des inspecteurs généraux et des chercheurs peuvent être définies dans les mêmes termes (hormis la mission de contrôle), d’où une possible concurrence entre eux. La reconnaissance réciproque de leurs compétences respectives est encore à construire. Les inspecteurs généraux produisent des « dits d’experts », selon une méthodologie qui n’est pas celle des chercheurs, ils rédigent des préconisations destinées aux décideurs, ce que ne font pas les chercheurs. Mais leurs approches sont complémentaires, c’est pourquoi ils interviennent souvent ensemble dans les formations et les réflexions engagées par le ministère. Une conscience claire des différences entre inspecteurs généraux et chercheurs est la garantie d’une collaboration efficace entre eux et d’une médiation de qualité des travaux des chercheurs vers les cadres du système.