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Thesis

Spanish

ID: <

http://hdl.handle.net/10251/86786

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Where these data come from
Genomic organisation and bioinformatics analysis of snake poison toxin genes using various sequencing platforms

Abstract

[ES] El envenenamiento por mordedura de serpiente es un problema de salud pública que afecta a muchas de las comunidades rurales más pobres del mundo, principalmente las que practican la agricultura de subsistencia y las actividades de pastoreo en regiones tropicales y subtropicales de África, Asia, América Latina y Oceanía (Harrison et al., 2009). El envenenamiento ofídico es considerado por la Organización Mundial de la Salud (OMS) una enfermedad desatenidida. Por ello, su estudio es importante para desarrollar antivenenos que neutralicen los efectos tóxicos de los venenos, así como para aprovechar muchas de sus propiedades para el desarrollo de nuevos fármacos. Los análisis proteómicos han mostrado que los venenos de serpientes están generalmente constituídos por un número reducido de familias de toxinas multigénicas, donde las metaloproteasas representan uno de los componentes mayoritarios de los venenos de las familias Crotalidae y Viperidae (Markland y Swenson, 2013). La falta de datos genómicos impide llevar a cabo un estudio de genómica comparada entre las distintas especies de serpientes, por lo que no se conoce muy bien la estructura y distribución de los genes de las distintas subfamilias de metaloproteasas y disintegrinas. En este trabajo hemos amplificado, a partir del DNA genómico, genes de disintegrinas y metaloproteasas del ofidio Bitis arietans y hemos obtenido sus secuencias mediante secuenciación Sanger iterativa, lo que ha resultado en la caracterización de una subunidad de una nueva disintegrina dimérica. Así mismo, mediante la plataforma de secuenciación de tercera generación MiniON, secuenciamos ocho BACs (bacterial artificial chromosome) que incluían fragmentos genómicos del clúster de genes de metaloproteasas de la serpiente Bothrops jararaca. Mediante análisis bioinformático se anotó un contig codificante de 4 genes de metaloproteasas tipo PIII y 2 tipo PII dispuestos en tándem. Vercher Herráez, E. (2017). Organización genómica y análisis bioinformático de genes de toxinas de veneno de serpiente mediante diversas plataformas de secuenciación. http://hdl.handle.net/10251/86786

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