Se realiza la tipificación molecular de una muestra de 126 habitantes "criollos" de dos poblaciones del norte de Córdoba (Villa de Soto, en el noroeste y La Para, en el noreste) en los marcadores que determinan los principales linajes/haplogrupos mitocondriales amerindios y en el marcador DYS199*T (M3), diagnóstico de linaje paterno amerindio. El 79% de los individuos analizados pudo ser asignado a uno de los cuatro linajes maternos fundadores. La distribución de frecuencias resultó casi idéntica en las dos poblaciones, siendo los haplogrupos C y D los más frecuentes. Por otra parte, se encontró que sólo el 7,8% de los varones investigados poseen la variante DYS199*T, característica de amerindios. La distribución de linajes maternos amerindios de la muestra de Córdoba es similar a la encontrada en las poblaciones nativas de Patagonia y Tierra del Fuego, lo cual refuerza la hipótesis de un origen común, elaborada a partir de evidencias arqueológicas y morfológicas.